細(xì)胞STR鑒定國際標(biāo)準(zhǔn)推出以來，至今已有12年。人源細(xì)胞STR鑒定的公開可參比數(shù)據(jù)已增至8000+，然而小鼠細(xì)胞STR可參比數(shù)據(jù)則很少，目前為84個（截止2023.1）.
STR鑒定關(guān)注的細(xì)胞質(zhì)量控點(diǎn)主要有2個：一個是細(xì)胞系的身份識別，另一個是細(xì)胞系的種類交叉污染。
對于人源細(xì)胞系目前有大量的參考STR數(shù)據(jù)可比對，所以鑒定檢測的頻率更高。
對于小鼠細(xì)胞系，因公布的參考STR數(shù)據(jù)較少，所以鑒定檢測的頻率則較低。但是正因此，才需要對更多的小鼠細(xì)胞進(jìn)行STR檢測，通過與現(xiàn)有的小鼠STR數(shù)據(jù)比對，排除被已知STR數(shù)據(jù)的小鼠細(xì)胞污染或錯誤識別。進(jìn)行小鼠細(xì)胞STR檢測既能滿足發(fā)表文章雜志編輯對STR數(shù)據(jù)提交的要求，同時(shí)得到了相關(guān)小鼠細(xì)胞的STR數(shù)據(jù)，便于接受更多的第三方進(jìn)行評估。
然而在這個過程中，總會有些不規(guī)范和不合理的現(xiàn)象及結(jié)果會誤導(dǎo)大家對小鼠細(xì)胞STR鑒定的認(rèn)識。
在我們進(jìn)行小鼠細(xì)胞STR檢測的過程中，對所遇到的不規(guī)范不合理現(xiàn)象總結(jié)出來，供行業(yè)參考以避免不合理的結(jié)果解釋和認(rèn)識誤區(qū)。
一、目前小鼠細(xì)胞STR鑒定的標(biāo)準(zhǔn)位點(diǎn)為18個而非9個。
2019年，ATCC、NIST等單位聯(lián)合發(fā)表了一篇文章：《Interlaboratory study to validate a STR profiling method for intraspecies identification of mouse cell lines》，其中明確了小鼠細(xì)胞STR鑒定聯(lián)合采用1-1、1-2、2-1、3-2、4-2、5-5、6-4、6-7、7-1、8-1、11-2、12-1、13-1、15-3、17-2、18-3、19-2、X-1等18個STR位點(diǎn)。并公布了相關(guān)小鼠細(xì)胞的18個STR位點(diǎn)數(shù)據(jù)。目前cellosaurus數(shù)據(jù)庫提供的小鼠細(xì)胞STR參考數(shù)據(jù)都是基于18個小鼠STR位點(diǎn)的。由此可見小鼠細(xì)胞STR鑒定的標(biāo)準(zhǔn)位點(diǎn)是18個，對于采用9個小鼠STR位點(diǎn)進(jìn)行的檢測，其匹配準(zhǔn)確度自然大打折扣。
二、對于沒有公布STR參考數(shù)據(jù)的小鼠細(xì)胞，檢測結(jié)果卻是100%匹配結(jié)果的討論
一般進(jìn)行細(xì)胞STR數(shù)據(jù)比對時(shí)，都是以國際公布的STR數(shù)據(jù)庫進(jìn)行盲比，根據(jù)匹配度高低反應(yīng)該細(xì)胞的真實(shí)身份。尤其對于小鼠細(xì)胞，因公布的參比數(shù)據(jù)有限，可能很多小鼠細(xì)胞STR數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫比對后沒有80%（參考人源細(xì)胞的認(rèn)定標(biāo)準(zhǔn)）以上的結(jié)果。而對于數(shù)據(jù)庫都沒有提供STR數(shù)據(jù)庫的細(xì)胞，匹配度也達(dá)到100%的情況，可能的解釋只有企業(yè)自身有某個細(xì)胞，先行檢測了該細(xì)胞STR數(shù)據(jù)后并作為標(biāo)準(zhǔn)依據(jù),而不是與國際標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞庫的數(shù)據(jù)進(jìn)行比對的匹配結(jié)果。但需要注意的是，該標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)應(yīng)首先與目前國際公布的數(shù)據(jù)進(jìn)行盲比以排除該細(xì)胞沒有被已知細(xì)胞污染。在此前提下，該數(shù)據(jù)暫可作為企業(yè)內(nèi)部質(zhì)控的評估依據(jù)。但以此作為認(rèn)定依據(jù)時(shí)，需謹(jǐn)慎。附圖說明：1、MLE-12細(xì)胞，國際的標(biāo)準(zhǔn)STR數(shù)據(jù)庫未見該細(xì)胞的STR數(shù)據(jù)。2、檢測結(jié)果提示檢測細(xì)胞與MLE-12細(xì)胞的匹配度為100%，但備注的說法又與細(xì)胞庫描述的MLE-12細(xì)胞的背景信息不符。
三、對于小鼠細(xì)胞STR分型結(jié)果的解釋
STR分型結(jié)果反映的是該基因位點(diǎn)的核心重復(fù)序列的重復(fù)次數(shù)，所以結(jié)果是形如“12,13”的形式。在實(shí)際檢測過程中，因?yàn)橛械任换驑?biāo)準(zhǔn)品ladder，可直接得到”12,13”等分型結(jié)果。確保同一樣本不同時(shí)間，不同人員，不同儀器的可檢出重復(fù)結(jié)果。如果沒有等位基因標(biāo)準(zhǔn)品ladder,檢測分析時(shí)首先得到的是該STR基因位點(diǎn)的片段長度值（如：233.89），通過片段長度值及該位點(diǎn)的重復(fù)堿基數(shù)推算出“12,13”的分型結(jié)果。但此種缺乏標(biāo)準(zhǔn)品ladder的分析，因每次電泳的長度值存在偏離，存在分型錯誤的風(fēng)險(xiǎn)。如圖所示：
