短串聯(lián)重復序列(short tandem repeat, STR)是核心序列為2-6個堿基的短串聯(lián)重復結(jié)構(gòu)。20世紀90年代初,STR基因座首次作為一種重要的遺傳標記在人類親權(quán)鑒定中被使用(Edwards et al.,1992;Edwards et al.1991)。
STR分型檢測(short tandem repeat)是一種檢測技術(shù)。主要用于檢測人類及哺乳動物的基因組。
STR(short tandem repeat,短片段重復序列)廣泛存在于人類及哺乳動物的基因組中,具有高度多態(tài)性,它們一般由2-6個堿基構(gòu)成一個核心序列,核心序列串聯(lián)重復排列,由核心序列重復數(shù)目的變化產(chǎn)生長度多態(tài)性。對于一個特定的個體,染色體上某個特定位置的重復序列的重復次數(shù)是固定的,而對于不同的個體在同一位置處的重復次數(shù)可能不同,這就構(gòu)成了人群中這些重復序列的多態(tài)性。由于人類基因組中這種重復序列非常多,通過對這種多態(tài)性的檢測,就可以明確區(qū)分個體與個體的不同,確定父母子的親緣關(guān)系。
由于STR技術(shù)的高靈敏度、自動化程度高、準確快速、重復性好等優(yōu)點,STR基因分型已被作為金標準應(yīng)用于細胞鑒定,由于細胞系交叉污染或錯誤辨識而導致研究錯誤、結(jié)果不可重復等情況的存在,因此建議在實驗開展前進行細胞的STR鑒定分析。
細胞STR鑒定即通過STR信息建立細胞系的遺傳特性,通過STR鑒定來檢測細胞是否發(fā)生交叉污染或者誤認的情況。STR 基因座位上的等位基因可通過擴增區(qū)域內(nèi)重復序列拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細胞STR數(shù)據(jù)庫比對,從而推算出樣品所屬的細胞系或可能的交叉污染的細胞系名稱。